AutoCAD 2014

Preliminary Program

Print PDF
Program
Lunches (12:30 – 14:00) and dinners (19:30) will be from Sunday evening to Friday at lunch.
Sunday
17:00 -18:00 Registration
20:30 – 22:00 Opening Lecture
Applications in ab initio molecular dynamics of biomolecules – Paolo Carloni
Monday - Building up the bio-system and the classical setup.
9:00 – 12:30 Lectures
- X-Ray crystallography and protein data bases I - Doriano Lamba (CNR – Trieste)
- X-Ray crystallography and protein data bases II- Doriano Lamba (CNR – Trieste)
- The classical setup - Leonardo Guidoni (Univ. de L’Aquila)
15:00 – 18:00 – Computer Tutorials
From the PDB to a reliable atomistic model. – Doriano Lamba, Leonardo Guidoni, Carla
Molteni
18:30 – 19:30 Poster session with aperitif
Tuesday – Quantum Mechanics / Molecular Mechanics methods
9:00 – 12:30 Lectures
- General QM/MM methods and multigrid techniques - Teodoro Laino
- QM/MM applications – Carme Rovira
15:00 – 18:00 – Computer Tutorials
QMMM implementation in CPMD and CP2K. – Teodoro Laino, Carme Rovira
Wednesday – Spectroscopy and properties
9:00 – 12:30 Lectures
- Optical biospectroscopy – Tullio Scopigno
- Excites states in biomolecules I – Daniele Varsano
-
Excited states in biomolecule II - Daniele Varsano
14:30 – 16:30 Lectures
- Vibrational spectroscopy of biomolecules – Simonetta Fornarini
- Vibrational spectroscopy by AIMD – Rhodolphe Vuilleumier
17:30 – 22:00 – Social Excursion to Rocca Calascio with Social Dinner
Thursday - Spectroscopy and properties
9:30 – 13:00 Lectures
- Electron and proton transfer in biomolecules I - Jochen Blumberger
- Electron and proton transfer in biomolecules II - Jochen Blumberger
- Metadynamics I – Carla Molteni
14:30 – 15:30 Lectures
- Metadynamics II – Carla Molteni
16:00 – 18:30 Computer tutorials
- Effective normal modes - Rhodolphe Vuilleumier
Friday – Applications and Perspectives
9:00 – 11:30 Lectures
- Correlated QM/MM calculations for large biomolecules – Leonardo Guidoni
- Perspectives in ab initio MD for biomolecules. – Paolo Carloni
Departure
12:00 Shuttle bus to L’Aquila and Fiumicino/Ciampino airports (arrival in Fiumicino at 15:00)  

 

 

Lunches  (12:30 – 14:00) and dinners (19:30) will be from Sunday evening to Friday at lunch.  

   

 Sunday  

17:00 ­18:00  

 - Registration  

20:30 – 22:00 Opening Lecture  

  - Applications in ab initio molecular dynamics of biomolecules - Paolo Carloni  


 Monday ­ Building up the bio‐system and the classical setup  

9:00 – 12:30 Lectures  

  ‐ X‐Ray crystallography and protein data bases I - Doriano Lamba (CNR – Trieste)  

  ‐ X‐Ray crystallography and protein data bases II - Doriano Lamba (CNR – Trieste)  

  ‐ The classical setup ‐ Leonardo Guidoni (Univ. de L’Aquila)  

15:00 – 18:00 – Computer Tutorials  

  - From  the  PDB  to  a  reliable  atomistic  model - Doriano  Lamba,  Leonardo  Guidoni,  Carla Molteni  

18:30 – 19:30 Poster session with aperitif  


 Tuesday – Quantum Mechanics / Molecular Mechanics methods  

9:00 – 12:30 Lectures  

  ‐ General QM/MM methods and multigrid techniques ‐ Teodoro Laino   

  ‐ QM/MM applications – Carme Rovira  

15:00 – 18:00 – Computer Tutorials  

  - QM/MM implementation in CPMD and CP2K - Teodoro Laino and Carme Rovira  

 

 Wednesday – Spectroscopy and properties  

9:00 – 12:30 Lectures  

  ‐ Optical biospectroscopy - Tullio Scopigno   

  ‐ Excites states in biomolecules  I - Daniele Varsano  

  ‐ Excited states in biomolecules II ‐ Daniele Varsano 

14:30 – 16:30 Lectures  

  ‐ Vibrational spectroscopy of biomolecules - Simonetta Fornarini  

  ‐ Vibrational spectroscopy by AIMD - Rhodolphe Vuilleumier  

17:30 – 22:00 – Social Excursion to Rocca Calascio with Social Dinner  

 

 Thursday – Spectroscopy and properties  

9:30 – 13:00 Lectures  

 ‐ Electron and proton transfer in biomolecules I ‐ Jochen Blumberger  

 ‐ Electron and proton transfer in biomolecules II ‐ Jochen Blumberger  

 ‐ Metadynamics I – Carla Molteni  

14:30 – 15:30 Lectures  

  ‐ Metadynamics II - Carla Molteni  

16:00 – 18:30 Computer tutorials  

  ‐ Effective normal modes ‐ Rhodolphe Vuilleumier  

 

 Friday – Applications and Perspectives  

9:00 – 11:30 Lectures  

  ‐ Correlated QM/MM calculations for large biomolecules - Leonardo Guidoni  

  ‐ Perspectives in ab initio MD for biomolecules - Paolo Carloni  

  

12:00  Departure  

Shuttle bus to L’Aquila and Fiumicino/Ciampino airports (arrival in Fiumicino at 15:00) 

 

 

 

 

Webmaster Emanuele Coccia

Copyright © 2017 CBBC Group. All Rights Reserved.
Joomla! is Free Software released under the GNU/GPL License.